Метод является наиболее доступным и потому распространенным методом диагностики инфекционных (особенно трансмиссивных) заболеваний в ветеринарной медицине. Основан на выявлении возбудителя в клиническом материале по характерной морфологии.
Вид оптической микроскопии также используется для обнаружения спирохет - боррелий и лептоспир.
Световая микроскопия обеспечивает увеличение до 2 тысяч раз, цветное и подвижное изображение живого объекта, возможность микрокиносъемки и длительного наблюдения одного и того же объекта, оценку его динамики и химизма.